真空干燥机主要用于冷冻干燥病原微生物(毒)种。在操作过程中，会产生大量含有病原微生物的气溶胶，容易引起实验室感染。因此，如果没有高效的过滤装置，通常需要在负压通风柜中操作，或者在真空排气口安装高效过滤器，防止病原微生物扩散。病原微生物可能会从高效过滤器损坏或负压通风柜故障中逸出，这可能会导致实验室感染，需要我们高度重视。
(一)真空干燥机高效过滤器损坏的处理
当高效过滤器在干燥菌(毒)种过程中损坏时，应迅速处理，不得带“病”工作。具体处理方法如下。
1.处置方法
首先要立即停止冷冻干燥活动，切断电源，迅速关闭冷冻干燥的样品容器盖，然后向实验室主任报告，然后用消毒剂(根据病原微生物特性选择消毒剂)对容器表面和冷冻室进行消毒去污，然后更换高效过滤器，填写处理记录。
2.处置要点
处理此类事件时，应立即采取措施防止感染性物质进一步扩散，如立即停止干燥机运行，密封感染性物质的容器盖；二是处置人员应采取个人防护措施，防止感染；第三，干燥机应立即彻底消毒，消除污染；第四，及时更换高效过滤器，按照规定的程序报告，并做好事件处置记录。
3.处置流程
真空冷冻干燥机高效过滤器损坏处理流程图
(二)负压通风机在干燥过程中出现故障的处理
在冷冻干燥过程中，由于真空抽吸过程中会产生大量含有病原微生物的气溶胶，如果真空干燥机的排气口没有高效的过滤装置，会直接导致病原微生物的传播，很可能导致实验者感染。因此，原则上，这种操作需要在负压通风柜或有气流组织的实验室进行，尤其是类和第二类病原微生物菌(毒)的冷冻干燥必须在负压通风柜或生物安全柜进行。但当负压通风柜在干燥过程中出现故障或断电时，应立即组织下一个处理工具，以防止病原微生物传播。
1.处置方法
如发现通风机出现故障或断电，应先停止冷冻干燥，立即向实验室主任报告，静止30。～60分钟后，打开干燥机的冷冻室盖，盖上冷冻管(瓶)的盖子，对冷冻室和冷冻管(瓶)表面进行消毒和污染，同时对现场进行清洁和消毒，并记录处理过程。按照规定的程序维护设备。
2.处置要点
当发现通风机停止工作时，应立即停止冷冻干燥，然后立即向实验室主任报告，听取处置指导；冷冻管(瓶)等容器盖必须立即盖上，防止病原微生物继续溢出；做好污染去除工作，主要是对冷冻室、排气管、冷冻管(瓶)进行消毒。通风柜应按规定程序修复，个人防护措施应在处理过程中采取，防止感染。，做好处置记录。
